Genel seçmeli dersler Koç Üniversitesinde açılan tüm dersler içinden alınır.

CMSE 520 / BİOMOLEKÜLER YAPI,FONKSİYON VE DİNAMİĞİ
CMSE 590 / SEMİNER
CMSE 595 / TEZ
COMP 510 / BİLGİSAYAR GRAFİĞİ
COMP 515 / DAĞITIK BİLGİSAYAR SİSTEMLERİ
COMP 529 / PARALEL PROGRAMLAMA
COMP 554 / BİLGİSAYAR MÜHENDİSLİĞİNDEN SEÇİLMİŞ KONULAR
COMP 556 / BİLGİSAYAR MÜHENDİSLİĞİNDEN SEÇİLMİŞ KONULAR
COMP 570 / BİOİNFORMATİK VE BİLİŞİMSEL BİOLOJİ ALGORİTMALARI
ELEC 501 / RASTGELE SÜREÇLER
ELEC 505 / DOĞRUSAL SİSTEM TEORİSİ
ELEC 508 / BİLGİSAYARLA GÖRME VE GÖRÜNTÜ TANIMA
ELEC 518 / SAYISAL MODELLEME SİMÜLASYONU
ENGL 500 / AKADEMİK YAZIN TEKNİĞİ
ENGR 500 / UYGULAMALI OPTİMAL KONTROL
INDR 501 / ENİYİLEME MODELLERİ VE ALGORİTMALARİ
INDR 520 / AĞ MODELLERİ VE OPTİMİZASYONU
INDR 551 / ENDÜSTRİ MÜHENDİSLİĞİNDEN SEÇİLMİŞ KONULAR
INDR 553 / ENDÜSTRİ MÜHENDİSLİĞİNDEN SEÇİLMİŞ KONULAR
INDR 564 / DİNAMİK PROGRAMLAMA
INDR 568 / BULUŞSAL YÖNTEMLER
MASE 503 / TERMODİNAMİK VE KİNETİK
MASE 538 / MOLEKÜLLER ARASI KUVVETLER VE YÜZEY KUVVETLERİ
MASE 540 / MALZEMELERDE YÜZEYLER & ARAYÜZEYLER